Переносимость флуконазола обычно очень хорошая. Самое распространенное нежелательное явление – головная боль (13%). Часто встречаются побочные реакции со стороны желудочно–кишечного тракта (тошнота, боли в животе, поносы и метеоризм). Третьим по частоте побочным эффектом отмечается кожная сыпь (как проявление аллергии на флуконазол).
Еще одним достаточно частым нежелательным явлением выступает повышение уровней аланинаминотрансферазы (АЛТ), аспартатаминотрансферазы (АСТ) и щелочной фосфатазы.
Нечасто могут возникать анемия, потеря аппетита, сонливость или бессонница, сухость во рту, судороги, головокружения, изменение вкуса, вертиго, диспепсия (обычно сопровождающаяся запором), холестаз, желтуха, увеличение концентрации билирубина в крови, “лекарственная” сыпь, крапивница, зуд, повышенное потоотделение, миалгия, утомляемость, плохое самочувствие, астения, лихорадка.